NGS-Remote. Удаленное управление анализом данных NGS через Telegram-бота

Актуальность
Современные научные исследования, особенно в области биоинформатики и геномики, требуют значительных вычислительных ресурсов. Анализ данных NGS (Next-Generation Sequencing), является сложным и ресурсоемким процессом, который часто выполняется на мощных серверах. Однако управление такими задачами часто требует прямого доступа к серверу, что не всегда удобно для исследователей. Создание инструмента для удаленного управления вычислительными процессами через Telegram-бот решает проблему доступности и упрощает взаимодействие с данными, делая процесс более эффективным и удобным для пользователей.
Проблема
Отсутствие удобного и безопасного инструмента для удаленного управления вычислительными задачами. Исследователи и студенты сталкиваются с необходимостью прямого доступа к серверу через сложные интерфейсы или SSH, что требует технических навыков и создает риски с точки зрения информационной безопасности. Предлагаемый Telegram-бот решает эту проблему, предоставляя простой, интуитивно понятный интерфейс для запуска, мониторинга и получения результатов анализа данных.
Цель
Разработка Telegram-бота для удаленного управления вычислительными задачами, связанными с анализом данных NGS. Бот должен обеспечивать удобный интерфейс для запуска задач, мониторинга их выполнения, получения логов и результатов, а также гарантировать безопасность взаимодействия с сервером для нескольких пользователей.
Задачи
1. Анализ требований и проектирование системы: Определить функциональные требования к боту, спроектировать архитектуру взаимодействия между Telegram-ботом, сервером и вычислительной машиной, а также выбрать технологический стек для реализации. 2. Разработка базового функционала бота: Реализовать основные команды для управления задачами (например, запуск анализа, проверка статуса, получение логов) 3. Обеспечение информационной безопасности: Внедрить механизмы авторизации пользователей (например, через Telegram ID или OAuth), обеспечить безопасность передачи данных и защиту от несанкционированного доступа. 4. Интеграция с вычислительной машиной: Написать скрипты для выполнения анализа данных NGS (например, 16S или bulk RNA-seq) и настроить взаимодействие бота с сервером через SSH или REST API. 5. Разработка системы логирования и обратной связи: Создать понятный формат логов и сообщений для пользователей, чтобы предоставлять информацию о статусе выполнения задач и результатах анализа. 6. Тестирование и оптимизация: Провести нагрузочное тестирование системы, устранить ошибки и оптимизировать производительность. Подготовить документацию для пользователей и инструкции по использованию бота.
Результат
Готовый Telegram-бот, обеспечивающий удаленный доступ к вычислительным ресурсам для выполнения анализа данных NGS. Бот будет поддерживать функции запуска задач, мониторинга их статуса, получения логов и результатов анализа. Система будет включать механизмы авторизации пользователей, безопасного взаимодействия с сервером и удобного интерфейса для взаимодействия через Telegram. Результат также включает набор скриптов для анализа данных, документацию для пользователей и инструкции для дальнейшего масштабирования решения под другие типы задач.
Партнёры проекта
Genotek
***